CAPI2006 - Calcolo ad Alte Prestazioni nelle scienze della vita (Biocomputing)
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Programma della conferenza

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Convegno Calcolo ad Alte Prestazioni nelle scienze della vita (Biocomputing)

Milano, 16 e 17 Ottobre 2006

16 Ottobre 2006


10.00 Registrazione

10.30 Saluti e introduzione al convegno

Fiorenzo Galli - Direttore Museo Nazionale della Scienza e della Tecnologia
(assente sostituito da Giovanni Crupi)

Marcello Fontanesi − Rettore Università degli Studi di Milano − Bicocca − Presidente CILEA (assente)

Adriano De Maio - Sottosegretario Alta Formazione, Ricerca e Innovazione - Regione Lombardia

Luigi Rossi Bernardi - Assessore Ricerca, Innovazione, Capitale Umano - Comune di Milano
(assente)

Alberto Albertini - Direttore Istituto Tecnologie Biomediche - CNR, Milano


10.50 - 13.00 Prima Sessione

Relazione introduttiva

Luciano Milanesi - CNR-ITB, Milano

Contributi scientifici

Progettazione razionale di mimici dei carboidrati

Anna Bernardi - Università degli Studi di Milano

Computer simulations of biomolecular systems

Giorgio Colombo - CNR-ICRM, Milano

BLAST sul Demonstrator: un nuovo portale per lanciare BLAST sfruttando le potenzialità della GRID

Giuseppe La Rocca - INFN - Sezione di Catania

Applicazione a problemi di somministrazione di farmaci delle tecniche di supercalcolo legate alla risoluzione di Equazioni di Hamilton-Jacobi in  dimensione alta


Enrico Bersani - (assente - sostituito da Piero Lanucara) - CNR-ISMAC


Lunch

14.20 - 16.15 Seconda Sessione

Contributi scientifici

Computing infrastructure for drug design within pharmceutical industry

Alfonso Pozzan - GlaxoSmithKline, Verona


Il supercalcolo paralleo al servizio della farmaceutica: DELOS, una piattaforma  bioinformatica per il drug - discovery

Piercarlo Fantucci  - Università degli Studi  di Milano Bicocca

High performance computing and in silico drug design: quo vadis?

Stefano Moro - Università degli Studi di Padova

High performance computing per il drug design cardiovascolare

Carmelina Ruggiero - Università degli Studi di Genova

Coffee break

16.15 - 17.30 Tavola Rotonda

L'importanza per la società della ricerca basata sul Calcolo ad Alte Prestazioni



Introduce e coordina il Prof. Enrico Bellone − Storico della scienza − Università degli Studi di Milano

Partecipano:

Intervento di apertura Rita Levi Montalcini (intervista registrata)

Eugenio Santoro (assente) − Istituto Mario Negri

Luca Sartori − Genextra

Christian Orrenius - Nerviano Medical Sciences

Alessandro Veneziani − Politecnico di Milano

Amilcare Collina - MAPEI e Confindustria

Giuseppe Caravita − Giornalista Il Sole 24 ore


17 Ottobre 2006

9.15 - 10.55
Prima sessione

Contributi scientifici

Simulazione di processi biologici con i sistemi a membrane

Daniela Besozzi - Università degli Studi Milano

Bio-molecular diagnosis through random subspace ensembles of learning machines

Giorgio Valentini -
Università degli Studi di Milano

Metodi di apprendimento automatico per l'annotazione strutturale e funzionale
di genomi


Ivan Rossi - Università degli Studi di Bologna

Computational dissection of large gene-expression dynamics (by the correlation
method)reveals pathways co-regulation changes by conditional transcription factor
activation


Gastone Castellani -
Università degli Studi di Bologna e INFN

Modelling Immune System: a challenge for HPC and Grid Computing
Santo Motta - Università degli Studi di Catania

Coffee break


11.10 - 13.15 Seconda Sessione

Contributi scientifici

High performance computing in studies of proteins. A comparative moleculardynamics investigation of psycrophilic and mesophylic elastases

Luca De Gioia
- Università degli Studi Milano Bicocca

Il ruolo di un centro HPC nel supporto delle Scienze della vita

Elda Rossi
- CINECA

Applicazione GRID per il confronto esaustivo delle regioni genomiche conservate tra uomo e topo

Graziano Pesole
- Università degli Studi di Bari

sostitutito da (assente sostiutito da Flavio Mignone) - Università degli Studi di Milano

Applicazioni del calcolo avanzato nell'ambito delle biotecnologie presso il CEINGE

Giovanni Paolella - Università degli Studi di Napoli "Federico II"

e-bioscience@CASPUR: sviluppo e consolidamento di una soluzione dedicata alla biologia computazionale

Tiziana Castrignanò


CILEA e LITBIO: una sinergia di successo

Claudio Arlandini
- CILEA, Segrate Milano

Lunch

14.30 - 16
.00 Tavola  Rotonda

Infrastrutture informatiche per la ricerca nelle scienze della vita e sintesi generale del convegno

Coordina gli interventi il Prof. Ivo De Lotto presidente AICA

Partecipano:

Piercarlo Fantucci -
Università degli Studi Milano Bicocca

Francesco Beltrame - CNR

Sanzio Bassini - CINECA

Nico Sanna - CASPUR

Giovanni Meloni - CILEA

Un rappresentante del Ministero dell'Università e della Ricerca


 
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