CAPI2006 - Calcolo ad Alte Prestazioni nelle scienze della vita (Biocomputing)
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Elda Rossi

Il ruolo di un centro HPC nel supporto delle Scienze della Vita


CINECA

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     Last modified: November 30, 2007

Abstract
Cineca e' un importante Centro di Calcolo italiano che ha lunga esperienza nel supporto delle attivita' di ricerca in ambito scientifico.
Negli ultimi anni, oltre a discipline quali la Chimica, la Fisica e l'Astronomia, storicamente legate al calcolo ad altre prestazioni, il Cineca ha aggiunto il supporto verso la Bioinformatica e le Scienze della vita in generale.
Per queste discipline tuttavia, le tecnologie HPC devono intendersi in un senso piu' ampio. Infatti i ricercatori impegnati in questo ambito non hanno attualmente bisogno di mera potenza di calcolo, o almeno non solo. Sono invece particolarmente interessati a tutta una serie di tecnologie che permettano l'uso piu' efficace e collaborativo degli strumenti e soprattutto la condivisione dei dati, che sono di centrale importanza per questa disciplina.
Le tecnologie piu' indicate afferiscono all'ambito delle Grid Computazionali e piu' precisamente alla accezione dei "servizi", sia Web Services che Grid Services. Per l'utilizzo di questi servizi gli strumenti di orchestrazione e sottomissione, chiamati "Workflow", sono altrettanto importanti poichè costituiscono l'interfaccia utente all'ambiente computazionale e ne permettono una efficace fruizione.
Le attivita' del Cineca in questo ambito sono soprattutto legate ad alcuni progetti attualmente in corso che verranno brevemente discussi:

- LIBI: un progetto nazionale per la progettazione e realizzazione di un ambiente distribuito per la bioinformatica

- EMBRACE: un progetto europeo per la realizzazione di un ambiente distribuito per la bioinformatica

- ImmunoGrid: un progetto europeo per la realizzazione di un simulatore del sistema immunitario umano.


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